以色列數十年結下不少仇敵，在此形勢下，以航一向是全球最常受威脅的航空公司之一，在六十年代末至八十年代，以航飛機和乘客便曾多次成為槍擊、劫機和炸彈襲擊目標（見表）。
正因如此，以航的保安措施特別嚴密，因而被公認為全球最安全的航空公司之一，過去二十年來未有一架客機被騎劫。
以色列《國土報》讚揚以航擁有「無敵的保安系統」，並非吹噓。以航要求搭客在客機起飛三小時前便要辦理登機手續，其間有數重保安措施——機場櫃位駐有武裝警衞（大都是以色列退伍軍人）、查問搭客時間較長（有時要求搜身）、客機上設便衣特警、機艙裝有兩重門以防劫機等。
特拉維夫的機場保安更特別嚴格，職員會詳細詢問乘客出遊的目的。
以航每年約花費七千八百萬港元在特嚴的保安措施上，大部份費用由以色列納稅人支付。
美聯社/法新社