菲律賓三寶顏大爆炸，至少有一點跟印尼峇里大爆炸相似，即兩個地方都不是回教徒勢力範圍的非回教徒聚居地，讓回教激進組織不會傷害到「自己人」。
菲律賓是天主教國家，但南部棉蘭老島卻在回教範圍，天主教徒聚居的三寶顏位於棉蘭老島西南岸，長期是被指為周四爆炸幕後黑手的阿布沙耶夫從事炸彈襲擊、搶劫和綁架人質的地方。
九一年成立的阿布沙耶夫被指跟拉登的阿蓋德組織有關，其中一名首領據說是拉登的妹夫，長期獲得阿蓋德的金錢援助和軍事訓練。
此外，菲律賓總統阿羅約夫人決定在總統府馬拉坎南宮內設置類似白宮軍事指揮中心的「作戰室」，親自督師反恐工作。
她周四在總統府向記者宣布：「我在這裏設立作戰室，把國防部的作戰搬到這裏來。」作戰室將配備先進通訊設備，二十四小時不停運作，讓她可在瞬間掌握全國最新情況。
阿羅約夫人表明會以軍警打擊行動及經濟發展作為反恐的兩大手段，作戰室內一邊會懸掛菲律賓地圖，詳列各項經濟發展的進展，以此解決造成回教及共黨游擊隊猖獗的根源──貧窮；另一邊則是軍警對阿布沙耶夫游擊隊及共黨「新人民軍」的清剿行動進展。
綜合外電報道