經過連日來引發的統獨對立、朝野爭議、對岸（大陸）反彈、民調支持而輿論批評，台灣當局決定在護照封面加印「ISSUEDINTAIWAN」的問題，已發展成一個「Taiwanissue」（台灣問題）也。
據台灣民調顯示，超過半數的台灣民眾，認可在護照封面加註，並傾向相信政府關於區隔中華民國與中華人民共和國的解釋。但輿論界則對這做法多有批評之聲。
民眾認可加註，是因為過去許多年來，台灣人在外國，總要常常不厭其煩地，向外國人解釋他們的中華民國國籍，不是外國人所了解的中國（中華人民共和國）國籍，而是在台灣的中華民國，他們是台灣人，不是外國人所了解的中國人。這種口頭補充已使台灣人感到厭煩，他們認為在護照上加註，則只要把護照拿出來，不需多說就一切都明白了。
輿論批評有幾點理由。
首先，加註不會給旅遊帶來方便。因為台灣護照經過這麼多年台灣人在國外的頻繁旅遊，早已被世界各國所接受。旅遊業者表示，在進入外國時，通常會在入境表格的國籍一欄填「ROC,Taiwan」，從來不會有任何問題。一旦換了護照式樣，加了註，說不定反會被外國移民局官員把新護照當假護照，徒增困擾。
其次，護照封面加上簽發地點，可以說是全球唯一的做法。這做法無疑是奪去了台灣駐在各國的領事館或代表處的權力。因為若一個護照在紐約丟失，本可以在紐約的台灣駐美代表處領到一本新護照，若新護照在封面上也要印上「台灣簽發」，那不是很荒謬的事？以後人們如何辨識護照是在何處簽發的呢？而且，這種自己設限簽發地點的做法，實際上等於降低了中華民國的國際地位。
其三，在定義上，「台灣簽發」所指的台灣是甚麼？按照台灣的中華民國憲法，並沒有出現過「台灣」這個詞，而只是以「國家統一前」的「自由地區」，來表述目前中華民國政府所統屬的台、澎、金、馬地域。
台灣當局所定的《台灣地區與大陸地區人民關係條例》也沒有單獨稱「台灣」的字眼，所提到的「台灣」都叫「台灣地區」，並在條例的第二條說明：「台灣地區包括台、澎、金、馬及其附屬島嶼」。
「台灣簽發」的「台灣」，尚未成為一個政權稱謂，它只能被當作一個地點，而設限簽發地點的做法，如上所述，並不明智。
因此，護照加註之舉，無便民之利，而有自我設限及定義混淆之弊。有人批評此舉是政治「自慰」，在國際外交無任何進展的情形下，只能拿這種在自己的護照上加些字眼來滿足符號上的勝利，算是向獨立前進一步了，此非自欺欺人乎？